Все четыре фильма о Борне имели название, соответствующее названию книги Роберта Ладлэма — «Идентификация Борна» (2002), «Превосходство Борна» (2004), «Ультиматум Борна» (2007), «Эволюция Борна» (2012). Таким образом, «Джейсон Борн» должен был бы называться «Предательство Борна». Название фильма «Джейсон Борн» было объявлено 7 февраля 2016 года, в день выхода первого трейлера.

Каждая следующая часть франшизы с Мэттом Дэймоном в главной роли была успешней предыдущей: мировые сборы последней картины составили почти 443 миллиона долларов.

Несмотря на то, что фильм «Эволюция Борна» с Джереми Реннером в главной роли получил смешанные отзывы, компания Universal заявила о планах выпустить ещё несколько картин об агенте. В интервью 2012 года Мэтт Дэймон сообщил, что они с Полом Гринграссом хотели бы поработать снова вместе над следующей частью франшизы. В сентябре 2014 года стало известно, что актёр и режиссёр и правда примут участие в съемках фильма «Джейсон Борн».

В 2015 году к проекту присоединились Джулия Стайлз (Ники Парсонз), Алисия Викандер, Томми Ли Джонс (Роберт Дьюи), Венсан Кассель. Вигго Мортенсен тоже вёл переговоры об участии в съёмках.

Съёмки фильма начались в сентябре 2015 года. Они проходили в Великобритании, Германии, США. Часть истории боевика происходит в Греции. Создатели ленты хотели снять соответствующие сцены в Афинах и обратились к правительству страны. Однако из-за высоких налогов и бюрократии продюсеры были вынуждены отказаться от этой идеи. Сцены в Афинах снимались на Тенерифе, самом крупном из Канарских островов.